Skip to content

用户数据共享

智算平台支持两类常见数据使用方式:一类是访问平台提供的公共数据镜像资源,另一类是在明确授权后实现课题组或项目成员之间的数据目录共享。

公共数据镜像站

研究所提供了公共数据镜像站,用户可通过浏览器访问:

https://mirrors.tibhpc.net/

镜像站对应的集群公共数据目录为:

bash
/hpcfs/fpublic/database

该网址仅限所内用户或所内网络环境访问。如在外网无法打开,请切换到所内网络或按平台要求接入后再访问。

数据镜像站页面

该页面用于集中展示和检索平台同步的公共数据资源。用户可根据实际需求进入镜像站查看可用数据集,按分类浏览或搜索相关数据库。

镜像站页面主要包含以下内容:

模块说明
组学数据库提供基因组、蛋白组、代谢组等常用公共数据资源
主流生物库包含 NCBI、Ensembl、UniProt 等常用生物信息数据库镜像
基础数据集提供物种基因组、蛋白结构、代谢通路等基础数据资源
系统与软件提供部分操作系统、开发工具或生信软件相关镜像资源

镜像站适合用于获取公开数据库、公共参考数据和常用软件资源。用户如需使用公共数据,可优先访问镜像站确认是否已有对应资源,避免重复下载和重复占用存储空间。

集群内数据隔离

默认情况下,集群内不同用户的数据目录是相互隔离的。普通用户只能访问自己有权限的目录和文件,不能直接读取、修改其他用户的数据。

这种隔离机制用于保护用户数据安全,避免误删、误改或未经授权的数据访问。

多用户目录共享

如果同一课题组、项目组或协作任务需要多人共同访问某个数据目录,可以联系管理员申请目录权限互通。

管理员可根据实际需求,通过 ACL 权限控制实现目录共同访问。常见场景包括:

  • 多名用户共同处理同一批实验数据。
  • 项目成员需要共享输入数据、参考数据库或分析结果。
  • 课题组希望建立统一的数据目录,便于成员协作使用。
  • 需要给指定用户开放只读或读写权限。

申请时建议说明以下信息:

信息示例
共享目录路径/hpctmp/project/example
需要授权的用户user01user02
权限类型只读、读写
使用原因项目协作、共同分析数据、共享参考库
使用期限长期使用或指定结束时间

权限开通后,相关用户即可按照管理员配置的权限共同访问该目录。

使用建议

  • 公共数据库和公共参考数据优先查看镜像站是否已经提供。
  • 项目协作数据建议集中放在约定目录中,不要分散到多个个人目录。
  • 共享目录应明确负责人,由负责人维护目录结构和数据版本。
  • 不再需要共享时,应及时联系管理员取消权限。
  • 涉及敏感数据或未公开数据时,应先确认数据使用和共享范围。

如需申请目录共享或确认公共数据位置,请联系平台管理员协助处理。

Copyright 2021 All Rights Reserved 生物设计中心 版权所有