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太行I号数据与智算平台用户手册

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当前版本:V20250715.4

一、平台概述

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Tags
☀️1. 平台配置概述
RFC
🚎2. 集群队列介绍
RFC
🍀3.超算门户CHESS简介
RFC
4. 收费标准
RFC
🍌5.平台常用软件列表
RFC


二、超算登陆与基础知识

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Tags
🚜1. 登录智算平台
RFC
🧷 2.HPC常用命令(Linux)
Draft
🍌3.文件传输
Draft
🍌4.编写和运行python程序
Draft
🍌5.使用Tmux后台运行任务
Draft


三、运行环境

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Tags
1.Modules
RFC
🍌2.Conda
RFC
🍌3.容器-Singularity
Draft
🍌4. 虚拟云桌面
Draft


四、Slurm 作业调度系统

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Tags
🏅1. Slurm 作业调度系统
Draft
🥅2. Sbatch批量提交作业示例
Draft
🚀3.Srun运行作业示例
Draft
🚵🏽‍♀️4. Salloc 提交作业示例
Draft


五、软件应用

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Tags
synopsis
💠1. R 集群使用方法
Draft
作业脚本R 语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言,它广泛应用于数学尤其是统计学领域。
⏱️2. Alphafold 2 使用方法
Draft
作业脚本AlphaFold 2是一款能精准预测蛋白质三维结构的人工智能工具。
💠3.Jupyter集群使用方法
Draft
作业脚本Jupyter集群是可实现多用户协同、高效运行Jupyter服务的分布式计算环境。
4.Matlab集群使用方法
Draft
作业脚本MATLAB集群是支持多节点并行计算、可显著提升MATLAB程序运行效率的分布式计算系统。
5.Vscode集群使用方法
Draft
作业脚本VS Code集群是支持多用户协同开发、高效运行VS Code服务的分布式计算环境。
🍌6.PyCharm使用方法
Draft
作业脚本PyCharm是一款专为Python开发设计的集成开发环境(IDE)。
7.Gaussian集群使用方法
Draft
作业脚本Gaussian是一款用于化学分子模拟与计算的专业软件。
8.Amber集群使用方法
Draft
作业脚本Amber是用于分子动力学模拟的专业软件包。
💠9.Foldseek集群使用方法
Draft
作业脚本Foldseek集群是支持大规模蛋白质结构搜索的分布式计算环境。
💠10.OpenMPI集群使用方法
Draft
作业脚本OpenMPI集群是基于OpenMPI实现多节点并行通信的分布式计算系统。
🍀11.VASP集群使用方法
Draft
作业脚本VASP集群是用于材料科学与计算物理领域的高性能并行计算平台。
🚖12.常用生信工具镜像使用方法
Draft
作业脚本生信工具常用生信工具涵盖序列处理、功能分析、组学研究等多领域,是生物信息学研究的核心支撑。
🍌13.ColabFold使用方法
RFC
作业脚本ColabFold是基于AlphaFold2的开源蛋白质结构预测工具,支持云端快速部署与使用。
⛸️14.AF3 批量结构预测方法
Draft
作业脚本生信工具一种用于蛋白质结构预测的工具,支持批量处理。
🍌15.ParallelFold集群使用方法
Draft
作业脚本生信工具面向大规模蛋白质结构预测的高性能计算平台
🍌16.Boltz-2集群使用方法
Draft
作业脚本生信工具Boltz-2是整合结构与亲和力预测、兼具高效性与物理合理性的生物分子共折叠基础模型。