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太行I号数据与智算平台用户手册

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当前版本:V20250325.4

一、平台概况


二、超算登陆与基础知识

基本使用方法

NameCreatedDateStatusTags
🚜1. 登录智算平台
RFC
🧷 2.HPC常用命令(Linux)
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🍌3.文件传输
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🍌4.编写和运行python程序
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🍌5.使用Tmux以后台方式运行任务
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三、运行环境

NameCreatedDateStatusTags
1.Modules
RFC
🍌2.Conda
RFC
🍌3.容器-Singularity
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🍌4. 虚拟云桌面
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四、Slurm 作业调度系统

NameCreatedDateStatusTags
🏅1. Slurm 作业调度系统
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🥅2. Sbatch批量提交作业示例
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🚀3.Srun运行作业示例
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🚵🏽‍♀️4. Salloc 提交作业示例
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五、软件应用

NameAI summaryCreatedStatusTags
💠1. R 集群使用方法
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⏱️2. Alphafold 2 使用方法
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💠3.Jupyter集群使用方法
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4.Matlab集群使用方法
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5.Vscode集群使用方法
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🍌6.PyCharm使用方法
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7.Gaussian集群使用方法
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8.Amber集群使用方法
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💠9.Foldseek集群使用方法
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💠10.OpenMPI集群使用方法
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🍀11.VASP集群使用方法
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🚖12.常用生信工具镜像使用方法
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🍌13.ColabFold使用方法
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⛸️14.AF3 批量结构预测方法AF3(AlphaFold3)是一种用于蛋白质结构预测的工具,支持批量处理。用户需申请模型权重,准备输入数据和参考数据库,并使用Singularity和Slurm提交任务,预测结果将包含PDB结构文件和JSON评分。
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作业脚本生信工具
🍌15.ParallelFold集群使用方法
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作业脚本生信工具