太行I号数据与智算平台用户手册
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当前版本：V20250715.4
【平台概述】
『超算登陆与基础知识』
『运行环境』
1.Modules
『Slurm 作业调度系统』
『软件应用』
一、平台概述
| Name | Created | Date | Status | Tags |
|---|---|---|---|---|
| ☀️1. 平台配置概述 | RFC | |||
| 🚎2. 集群队列介绍 | RFC | |||
| 🍀3.超算门户CHESS简介 | RFC | |||
| ⛳4. 收费标准 | RFC | |||
| 🍌5.平台常用软件列表 | RFC |
二、超算登陆与基础知识
| Name | Created | Date | Status | Tags |
|---|---|---|---|---|
| 🚜1. 登录智算平台 | RFC | |||
| 🧷 2.HPC常用命令（Linux） | Draft | |||
| 🍌3.文件传输 | Draft | |||
| 🍌4.编写和运行python程序 | Draft | |||
| 🍌5.使用Tmux后台运行任务 | Draft |
四、Slurm 作业调度系统
| Name | Created | Date | Status | Tags |
|---|---|---|---|---|
| 🏅1. Slurm 作业调度系统 | Draft | |||
| 🥅2. Sbatch批量提交作业示例 | Draft | |||
| 🚀3.Srun运行作业示例 | Draft | |||
| 🚵🏽♀️4. Salloc 提交作业示例 | Draft |
五、软件应用
| Name | Created | Status | Tags | synopsis |
|---|---|---|---|---|
| 💠1. R 集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | R 语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言，它广泛应用于数学尤其是统计学领域。 | |
| ⏱️2. Alphafold 2 使用方法 | Draft | 作业脚本 | AlphaFold 2是一款能精准预测蛋白质三维结构的人工智能工具。 | |
| 💠3.Jupyter集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | Jupyter集群是可实现多用户协同、高效运行Jupyter服务的分布式计算环境。 | |
 4.Matlab集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | MATLAB集群是支持多节点并行计算、可显著提升MATLAB程序运行效率的分布式计算系统。 | |
 5.Vscode集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | VS Code集群是支持多用户协同开发、高效运行VS Code服务的分布式计算环境。 | |
| 🍌6.PyCharm使用方法 | Draft | 作业脚本 | PyCharm是一款专为Python开发设计的集成开发环境（IDE）。 | |
 7.Gaussian集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | Gaussian是一款用于化学分子模拟与计算的专业软件。 | |
 8.Amber集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | Amber是用于分子动力学模拟的专业软件包。 | |
| 💠9.Foldseek集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | Foldseek集群是支持大规模蛋白质结构搜索的分布式计算环境。 | |
| 💠10.OpenMPI集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | OpenMPI集群是基于OpenMPI实现多节点并行通信的分布式计算系统。 | |
| 🍀11.VASP集群使用方法 | Draft | 作业脚本 | VASP集群是用于材料科学与计算物理领域的高性能并行计算平台。 | |
| 🚖12.常用生信工具镜像使用方法 | Draft | 作业脚本生信工具 | 常用生信工具涵盖序列处理、功能分析、组学研究等多领域，是生物信息学研究的核心支撑。 | |
| 🍌13.ColabFold使用方法 | RFC | 作业脚本 | ColabFold是基于AlphaFold2的开源蛋白质结构预测工具，支持云端快速部署与使用。 | |
| ⛸️14.AF3 批量结构预测方法 | Draft | 作业脚本生信工具 | 一种用于蛋白质结构预测的工具，支持批量处理。 | |
| 🍌15.ParallelFold集群使用方法 | Draft | 作业脚本生信工具 | 面向大规模蛋白质结构预测的高性能计算平台 | |
| 🍌16.Boltz-2集群使用方法 | Draft | 作业脚本生信工具 | Boltz-2是整合结构与亲和力预测、兼具高效性与物理合理性的生物分子共折叠基础模型。 |